Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP2Q7RTS6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
OTOP2Q7RTS6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms