Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZRN4Q6ZMN7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms