Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms