Protein–RNA interactions for Protein: Q6VN20

RANBP10, Ran-binding protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP10Q6VN20 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANBP10Q6VN20 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RANBP10Q6VN20 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANBP10Q6VN20 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANBP10Q6VN20 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RANBP10Q6VN20 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANBP10Q6VN20 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANBP10Q6VN20 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RANBP10Q6VN20 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANBP10Q6VN20 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANBP10Q6VN20 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANBP10Q6VN20 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RANBP10Q6VN20 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RANBP10Q6VN20 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RANBP10Q6VN20 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANBP10Q6VN20 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANBP10Q6VN20 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RANBP10Q6VN20 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RANBP10Q6VN20 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RANBP10Q6VN20 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RANBP10Q6VN20 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANBP10Q6VN20 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms