Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASC4Q6P4E1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASC4Q6P4E1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms