Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
WSCD1Q658N2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
WSCD1Q658N2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms