Protein–RNA interactions for Protein: Q63HM2

PCNX4, Pecanex-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4Q63HM2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PCNX4Q63HM2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
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