Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B1

RNF219, RING finger protein 219, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF219Q5W0B1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF219Q5W0B1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF219Q5W0B1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF219Q5W0B1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF219Q5W0B1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF219Q5W0B1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF219Q5W0B1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF219Q5W0B1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF219Q5W0B1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF219Q5W0B1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF219Q5W0B1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF219Q5W0B1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF219Q5W0B1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF219Q5W0B1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF219Q5W0B1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF219Q5W0B1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF219Q5W0B1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF219Q5W0B1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF219Q5W0B1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF219Q5W0B1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF219Q5W0B1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF219Q5W0B1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF219Q5W0B1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF219Q5W0B1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF219Q5W0B1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF219Q5W0B1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF219Q5W0B1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF219Q5W0B1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF219Q5W0B1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF219Q5W0B1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF219Q5W0B1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms