Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTUD1Q5VV17 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OTUD1Q5VV17 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
OTUD1Q5VV17 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OTUD1Q5VV17 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OTUD1Q5VV17 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
OTUD1Q5VV17 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUD1Q5VV17 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD1Q5VV17 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms