Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARHGAP40Q5TG30 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARHGAP40Q5TG30 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms