Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL5A1-AS1Q5SY13 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms