Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIA9

CBWD5, COBW domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBWD5Q5RIA9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBWD5Q5RIA9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBWD5Q5RIA9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBWD5Q5RIA9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBWD5Q5RIA9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBWD5Q5RIA9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBWD5Q5RIA9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBWD5Q5RIA9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBWD5Q5RIA9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBWD5Q5RIA9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CBWD5Q5RIA9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBWD5Q5RIA9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBWD5Q5RIA9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBWD5Q5RIA9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBWD5Q5RIA9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBWD5Q5RIA9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBWD5Q5RIA9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBWD5Q5RIA9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CBWD5Q5RIA9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CBWD5Q5RIA9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CBWD5Q5RIA9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBWD5Q5RIA9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CBWD5Q5RIA9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CBWD5Q5RIA9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBWD5Q5RIA9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CBWD5Q5RIA9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBWD5Q5RIA9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBWD5Q5RIA9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBWD5Q5RIA9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBWD5Q5RIA9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBWD5Q5RIA9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms