Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC158Q5M9N0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC158Q5M9N0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC158Q5M9N0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms