Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A13Q5J8X5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms