Protein–RNA interactions for Protein: Q53EP0

FNDC3B, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3BQ53EP0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC3BQ53EP0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms