Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms