Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMA3Q16787 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA3Q16787 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA3Q16787 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
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