Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMA4Q16363 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMA4Q16363 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
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