Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGA3Q16281 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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