Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIC1Q15915 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZIC1Q15915 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZIC1Q15915 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ZIC1Q15915 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZIC1Q15915 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZIC1Q15915 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZIC1Q15915 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC1Q15915 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC1Q15915 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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