Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SURF1Q15526 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
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