Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms