Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TLR1Q15399 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms