Protein–RNA interactions for Protein: Q13976

PRKG1, cGMP-dependent protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKG1Q13976 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKG1Q13976 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKG1Q13976 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms