Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP1A4Q13733 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP1A4Q13733 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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