Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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