Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN3Q13286 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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