Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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ERCC8Q13216 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERCC8Q13216 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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ERCC8Q13216 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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ERCC8Q13216 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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ERCC8Q13216 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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ERCC8Q13216 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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