Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHAF1AQ13111 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHAF1AQ13111 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
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