Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXC1Q12948 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FOXC1Q12948 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXC1Q12948 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXC1Q12948 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FOXC1Q12948 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXC1Q12948 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXC1Q12948 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXC1Q12948 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXC1Q12948 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FOXC1Q12948 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXC1Q12948 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXC1Q12948 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXC1Q12948 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXC1Q12948 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXC1Q12948 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXC1Q12948 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FOXC1Q12948 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXC1Q12948 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXC1Q12948 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXC1Q12948 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXC1Q12948 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXC1Q12948 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXC1Q12948 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXC1Q12948 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXC1Q12948 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXC1Q12948 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXC1Q12948 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXC1Q12948 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXC1Q12948 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXC1Q12948 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXC1Q12948 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXC1Q12948 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXC1Q12948 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXC1Q12948 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXC1Q12948 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXC1Q12948 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXC1Q12948 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXC1Q12948 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXC1Q12948 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXC1Q12948 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXC1Q12948 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXC1Q12948 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FOXC1Q12948 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXC1Q12948 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXC1Q12948 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXC1Q12948 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXC1Q12948 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXC1Q12948 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXC1Q12948 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXC1Q12948 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXC1Q12948 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXC1Q12948 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXC1Q12948 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FOXC1Q12948 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXC1Q12948 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXC1Q12948 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXC1Q12948 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXC1Q12948 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXC1Q12948 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXC1Q12948 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXC1Q12948 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXC1Q12948 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXC1Q12948 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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FOXC1Q12948 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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FOXC1Q12948 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXC1Q12948 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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