Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCBP1Q09161 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NCBP1Q09161 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms