Protein–RNA interactions for Protein: Q08881

ITK, Tyrosine-protein kinase ITK/TSK, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITKQ08881 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ITKQ08881 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITKQ08881 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITKQ08881 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITKQ08881 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITKQ08881 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITKQ08881 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITKQ08881 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITKQ08881 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITKQ08881 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITKQ08881 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITKQ08881 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITKQ08881 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITKQ08881 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ITKQ08881 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITKQ08881 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITKQ08881 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITKQ08881 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITKQ08881 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITKQ08881 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITKQ08881 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITKQ08881 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITKQ08881 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITKQ08881 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITKQ08881 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITKQ08881 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITKQ08881 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITKQ08881 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITKQ08881 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITKQ08881 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITKQ08881 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITKQ08881 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITKQ08881 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITKQ08881 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITKQ08881 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITKQ08881 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITKQ08881 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITKQ08881 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITKQ08881 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITKQ08881 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITKQ08881 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITKQ08881 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITKQ08881 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITKQ08881 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITKQ08881 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITKQ08881 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITKQ08881 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITKQ08881 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITKQ08881 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITKQ08881 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ITKQ08881 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ITKQ08881 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ITKQ08881 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ITKQ08881 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITKQ08881 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITKQ08881 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITKQ08881 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITKQ08881 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITKQ08881 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITKQ08881 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITKQ08881 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITKQ08881 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITKQ08881 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITKQ08881 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITKQ08881 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITKQ08881 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITKQ08881 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITKQ08881 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITKQ08881 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITKQ08881 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ITKQ08881 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITKQ08881 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITKQ08881 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITKQ08881 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITKQ08881 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITKQ08881 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITKQ08881 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITKQ08881 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITKQ08881 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITKQ08881 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITKQ08881 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITKQ08881 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITKQ08881 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITKQ08881 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITKQ08881 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITKQ08881 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITKQ08881 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITKQ08881 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITKQ08881 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITKQ08881 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITKQ08881 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITKQ08881 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITKQ08881 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITKQ08881 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITKQ08881 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITKQ08881 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITKQ08881 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITKQ08881 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITKQ08881 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITKQ08881 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms