Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PUDPQ08623 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms