Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4CQ08493 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms