Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE4BQ07343 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms