Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK18Q07002 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK18Q07002 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms