Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.4 ms