Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC4Q03721 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCNC4Q03721 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCNC4Q03721 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCNC4Q03721 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC4Q03721 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC4Q03721 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC4Q03721 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC4Q03721 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC4Q03721 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC4Q03721 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC4Q03721 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KCNC4Q03721 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC4Q03721 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC4Q03721 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC4Q03721 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC4Q03721 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC4Q03721 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC4Q03721 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC4Q03721 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC4Q03721 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC4Q03721 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC4Q03721 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KCNC4Q03721 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC4Q03721 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC4Q03721 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC4Q03721 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC4Q03721 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC4Q03721 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC4Q03721 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC4Q03721 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC4Q03721 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC4Q03721 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC4Q03721 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCNC4Q03721 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC4Q03721 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC4Q03721 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC4Q03721 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC4Q03721 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC4Q03721 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC4Q03721 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC4Q03721 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC4Q03721 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC4Q03721 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KCNC4Q03721 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC4Q03721 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC4Q03721 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC4Q03721 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC4Q03721 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC4Q03721 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC4Q03721 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC4Q03721 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC4Q03721 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC4Q03721 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC4Q03721 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KCNC4Q03721 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC4Q03721 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC4Q03721 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC4Q03721 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC4Q03721 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KCNC4Q03721 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC4Q03721 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC4Q03721 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC4Q03721 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC4Q03721 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC4Q03721 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC4Q03721 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC4Q03721 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC4Q03721 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC4Q03721 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC4Q03721 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC4Q03721 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC4Q03721 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC4Q03721 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms