Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MUC3AQ02505 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MUC3AQ02505 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms