Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RELBQ01201 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RELBQ01201 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RELBQ01201 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RELBQ01201 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RELBQ01201 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RELBQ01201 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RELBQ01201 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RELBQ01201 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RELBQ01201 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RELBQ01201 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RELBQ01201 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RELBQ01201 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RELBQ01201 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RELBQ01201 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RELBQ01201 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RELBQ01201 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RELBQ01201 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RELBQ01201 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RELBQ01201 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RELBQ01201 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RELBQ01201 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RELBQ01201 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RELBQ01201 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RELBQ01201 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RELBQ01201 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RELBQ01201 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RELBQ01201 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RELBQ01201 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RELBQ01201 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RELBQ01201 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RELBQ01201 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RELBQ01201 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RELBQ01201 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RELBQ01201 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RELBQ01201 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RELBQ01201 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RELBQ01201 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RELBQ01201 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RELBQ01201 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RELBQ01201 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RELBQ01201 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RELBQ01201 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RELBQ01201 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RELBQ01201 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RELBQ01201 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RELBQ01201 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RELBQ01201 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RELBQ01201 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RELBQ01201 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RELBQ01201 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RELBQ01201 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RELBQ01201 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RELBQ01201 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RELBQ01201 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RELBQ01201 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RELBQ01201 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RELBQ01201 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RELBQ01201 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RELBQ01201 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RELBQ01201 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RELBQ01201 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RELBQ01201 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RELBQ01201 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RELBQ01201 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RELBQ01201 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RELBQ01201 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RELBQ01201 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RELBQ01201 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RELBQ01201 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RELBQ01201 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RELBQ01201 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RELBQ01201 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RELBQ01201 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RELBQ01201 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RELBQ01201 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RELBQ01201 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RELBQ01201 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RELBQ01201 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELBQ01201 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELBQ01201 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELBQ01201 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELBQ01201 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELBQ01201 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELBQ01201 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELBQ01201 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELBQ01201 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELBQ01201 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELBQ01201 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELBQ01201 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RELBQ01201 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELBQ01201 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELBQ01201 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELBQ01201 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELBQ01201 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RELBQ01201 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RELBQ01201 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELBQ01201 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELBQ01201 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELBQ01201 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms