Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms