Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms