Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNRPEP62304 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPEP62304 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms