Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P61574 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms