Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM258P61165 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TMEM258P61165 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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TMEM258P61165 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TMEM258P61165 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TMEM258P61165 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TMEM258P61165 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TMEM258P61165 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TMEM258P61165 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TMEM258P61165 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TMEM258P61165 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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TMEM258P61165 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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TMEM258P61165 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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TMEM258P61165 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM258P61165 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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