Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC01547P58512 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms