Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX16P57768 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX16P57768 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX16P57768 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX16P57768 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX16P57768 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX16P57768 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX16P57768 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX16P57768 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX16P57768 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX16P57768 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX16P57768 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX16P57768 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX16P57768 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX16P57768 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX16P57768 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX16P57768 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX16P57768 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX16P57768 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX16P57768 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX16P57768 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX16P57768 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX16P57768 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX16P57768 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX16P57768 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX16P57768 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX16P57768 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX16P57768 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX16P57768 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX16P57768 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX16P57768 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX16P57768 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX16P57768 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX16P57768 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX16P57768 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX16P57768 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX16P57768 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX16P57768 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX16P57768 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX16P57768 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX16P57768 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX16P57768 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX16P57768 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX16P57768 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX16P57768 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX16P57768 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX16P57768 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX16P57768 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX16P57768 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX16P57768 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX16P57768 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX16P57768 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX16P57768 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX16P57768 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX16P57768 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX16P57768 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX16P57768 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX16P57768 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX16P57768 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX16P57768 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX16P57768 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX16P57768 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX16P57768 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX16P57768 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX16P57768 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX16P57768 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX16P57768 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX16P57768 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX16P57768 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX16P57768 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX16P57768 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX16P57768 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX16P57768 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX16P57768 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX16P57768 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX16P57768 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX16P57768 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX16P57768 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX16P57768 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX16P57768 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX16P57768 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX16P57768 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX16P57768 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX16P57768 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX16P57768 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX16P57768 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX16P57768 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX16P57768 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX16P57768 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX16P57768 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX16P57768 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX16P57768 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX16P57768 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX16P57768 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX16P57768 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX16P57768 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX16P57768 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX16P57768 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX16P57768 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX16P57768 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms