Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RWDD2BP57060 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms