Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX17P56962 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
STX17P56962 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX17P56962 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX17P56962 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX17P56962 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX17P56962 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX17P56962 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX17P56962 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX17P56962 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX17P56962 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX17P56962 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX17P56962 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX17P56962 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX17P56962 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX17P56962 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX17P56962 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX17P56962 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX17P56962 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX17P56962 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX17P56962 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX17P56962 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX17P56962 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STX17P56962 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STX17P56962 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STX17P56962 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STX17P56962 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STX17P56962 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STX17P56962 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
STX17P56962 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
STX17P56962 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
STX17P56962 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STX17P56962 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STX17P56962 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STX17P56962 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STX17P56962 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STX17P56962 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STX17P56962 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STX17P56962 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STX17P56962 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STX17P56962 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
STX17P56962 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STX17P56962 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STX17P56962 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STX17P56962 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STX17P56962 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STX17P56962 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
STX17P56962 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STX17P56962 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STX17P56962 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STX17P56962 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STX17P56962 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STX17P56962 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
STX17P56962 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STX17P56962 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STX17P56962 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STX17P56962 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STX17P56962 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
STX17P56962 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STX17P56962 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STX17P56962 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STX17P56962 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STX17P56962 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STX17P56962 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STX17P56962 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
STX17P56962 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX17P56962 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX17P56962 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX17P56962 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX17P56962 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX17P56962 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX17P56962 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX17P56962 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX17P56962 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX17P56962 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX17P56962 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX17P56962 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STX17P56962 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STX17P56962 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STX17P56962 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STX17P56962 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STX17P56962 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STX17P56962 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STX17P56962 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STX17P56962 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STX17P56962 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STX17P56962 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STX17P56962 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
STX17P56962 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STX17P56962 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STX17P56962 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STX17P56962 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STX17P56962 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STX17P56962 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STX17P56962 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STX17P56962 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STX17P56962 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STX17P56962 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STX17P56962 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
STX17P56962 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms