Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA1P56199 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ITGA1P56199 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms